马克思主义学院是承担全校本科生、硕士研究生、博士研究生思想政治理论课教学和思想政治教育本科专业培养的独立教学科研单位。2007年5月，在1976年成立的原马列部的基础上组建了马列部（哲学学院）；2011年1月，又独立设置马列部，2015年7月更名为马克思主义学院，2017年成为云南省首批重点培育马克思主义学院。经 2023 年 9 月 26 日校党委会议研究，为加强马克思主义理论学科和铸牢中华民族共同体意识理论研究，推动马克思主义学院“一流马院”建设，马克思主义学院与铸牢中华民族共同体意识研究院合署。

学院现有专任思政课教师共95人，其中，中央马克思主义理论研究与建设工程高校思想政治理论课课题组首席专家1人、全国高校思想政治理论课“四史”教育指导委员会委员1人、全国优秀教师、全国高校优秀思想政治理论课教师云南省道德模范一一敬业奉献模范云南省教育功勋奖1人，云南省兴滇英才“文化名家”1人、“教学名师”1人、青年拔尖人才2人，云南省“千人计划”青年人才2人，全国高校思想政治理论课教学能手、全国高校思想政治理论课教师影响力提名人物奖、云南省第二届思想政治理论课教师教学技能大赛一等奖、状元奖1人，全国高校思想政治理论课教学能手1人，云南省高校思想政治理论课教学研究会会长1人、副会长1人，云南省德育研究会副会长1人、云南省哲学学会副会长1人、云南省马克思主义理论学科教学指导委员会副主任1人、云南中华文明研究会副会长1人。学院已经形成以全国高校思政课教学指导委员会委员、云南省兴滇英才“教学名师”“文化名家”“青年拔尖人才”、云南省“千人计划”“万人计划”等高层次人才为领衔，教授、副教授为骨干，中青年博士为支撑的、结构科学合理的高素质教师队伍。

学院承担全校本硕博的公共思想政治理论课教学，2011年评估云南省思想政治理论课教学获“优秀等级”单位，是云南省高校“中国近现代史纲要”分课程教研中心和云南省高校思想政治理论课“手拉手”集体备课会组长单位，云南省高等学校思想政治理论课教学研究会会长单位、云南省高校德育研究会副会长单位、云南省哲学学会副会长单位。

学院于2012年获批思想政治教育本科专业，2013年开始招生，现有在校本科生426人。2017年学院成为马克思主义理论一级学科授权单位，2018年开始招生，下设马克思主义基本原理、思想政治教育、马克思主义中国化、中国近现代史专题研究等4个二级学科硕士点，现有在校硕士研究生226人。2020年学院马克思主义理论学科成为国家民委重点学科。目前，学院实现了自有本、硕一体和全校本、硕、博公共思想政治理论课一体化的教学科研体系。