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2024年4月19日下午,香港城市大学的Yudai Matsuda教授受邀到民族医药学院开展一场题为“基因组挖掘在天然产物发现中的应用”的专题讲座。此次讲座深入探讨了基因组挖掘技术在发现天然产物方面的重要性以及在克服技术挑战中取得的突破性进展。
天然产物的发现对于药物研发具有重要价值。然而,从大量可用的基因组序列中有选择地获取被发现的天然产物的生物合成基因簇仍然是一个重大挑战。
为了解决这一难题,香港城市大学Yudai Matsuda团队开发了一种名为FunBGCeX的真菌基因组挖掘工具,该工具可针对编码缺乏可检测蛋白结构域的酶的生物合成基因簇进行精准识别。
该工具通过全面查找,发现了一系列具有独特特征的基因簇,其中包括编码Pyr4家族萜类环化酶同源物的基因簇,这些基因簇通常被现有的生物信息学工具所忽视。不仅如此,该工具的运用,揭示了首个真菌蕗酮类三萜化合物的生物合成途径和前所未见的蕗酮类合成酶,还发现了形成邻苯二甲酸酯和氢醌-龙脑烯杂交产物的不寻常生物合成机制。这些发现展示了基因组挖掘方法在揭示未被报道的生物合成途径和天然产物骨架形成方面的巨大潜力,为新颖的真菌天然产物的发现提供了新的思路和方法。
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此次讲座为师生们提供一个了解最新科研成果、拓展学术视野的机会。
讲座结束后,师生积极提问,与专家一同交流探讨科技创新的前沿问题,许多学生对生物合成领域表现出极大的兴趣。