陈晓舟 男 硕士 教授

受教育经历

• 2001.09-2004.07 云南大学非线性复杂系统研究中心 系统分析与集成专业 理学硕士

教学工作

• 承担本科生《大数据技术原理与应用》、《Hadoop大数据技术开发》、《Spark大数据技术》等课程的教学，以及研究生《生物医学大数据》、《生物信息计算》、《机器学习》等课程的教学。

主要研究方向

• 单细胞测序数据算法软件

• 生物信息高性能计算

• 云计算与大数据技术

承担科研项目

• 主持完成国家自然科学基金“融合m/z误差识别能力和RT路标信息的数据库搜索算法研究”,经费46万元，2015.1-2018.12，已结项。

承担教学项目

• 主持完成云南民族大学校级优质课程项目“大数据技术原理与应用”。

代表性论文

• Liu R, Huang X, Yang S, Du W, Chen X^* and Li H^*. Discovery of an independent poor-prognosis subtype associated with tertiary lymphoid structures in breast cancer. Front. Immunol. 15:1364506. doi: 10.3389/fimmu.2024.1364506

• Feng Liu, Shuhong Huang, Jiongsong, Xiaozhou Chen , Ziguo Song, Junguo Dong, Yao Liu , Xingxu Huang , Shengqi Wang, Xiaolong Wang& Wenjie Shu .Design ofprime-editing guide RNAs with deep transfer learning.nature machine intelligence (2023) doi.org/10.1038/s42256-023-00739-w.

• Xiaoqian Huang, Ruiqi Liu, Shiwei Yang, Xiaozhou Chen^* and Huamei Li^*. scAnnoX: an R package integrating multiple public tools for single-cell annotation[J]. PeerJ,(2024) in press.

• Wen-Tai Ma^#, Zhao-Yu Liu^#,Xiao-Zhou Chen^#,Zhen-Liang Lin,Zhong-Bing Zheng,Wei-Guo Miao,Shang-Qian Xie.  A protein identification algorithm for tandem mass spectrometry by incorporating the abundance of mRNA into a binomial probability scoring model.Journal of Proteomics 197(2019)53-59

• Shang-Qian Xie,Yue Han,Xiao-Zhou Chen,Tai-Yu Cao, Kai-Kai Ji,Jie Zhu, Peng Ling,and Chuan-Le Xiao.ISOdb: A Comprehensive Database of Full-Length Isoforms Generated by Iso-Seq，International Journal of Genomics，2018, Article ID 9207637,6 pages.

发明专利授权

• 发明专利授权：CHEN Xiaozhou, ZHENG Kai; Tandem Mass Spectrometry Method based on Machine Learning Protein Identification,  专利号：LU502582，国家：Luxembourg, 27/01/2023

• 发明专利授权：CHEN Xiaozhou,  ZHONG Qi ; SARS-CoV-2 Protein Secondary Structure Prediction  Method  Based on Deep Learning，专利号：LU502573，国家：Luxembourg, 27/02/2023

• 发明专利授权：陈晓舟；肖传乐；李华梅；陈君华，基于正反库特征信息匹配的蛋白质二级质谱鉴定方法。专利号：20150799966，授权公告日：2017.10.31，证书号第2676919号。

• 发明专利授权：陈晓舟；肖传乐；朱思敏；陈君华，基于泊松分布模型的蛋白质二级质谱鉴定方法。专利号：2015107999961,授权公告日：2017.7.18，证书号第2353904号。

• 发明专利授权：陈晓舟；肖传乐；朱思敏；李华梅；郑凯；李慧敏，基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法。专利号：ZL2014102984043,授权公告日：2017.1.18，证书号第2353904号。

• 发明专利授权：陈晓舟；肖传乐；郑凯；李华梅；李慧敏，基于峰强度识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法。专利号：ZL2014102992143, 授权公告日：2015.12.30，证书号第1885614号。

获奖情况

• 指导论文“基于候选肽段区分度的蛋白质二级质谱鉴定算法”获 2015年云南省优秀硕士学位论文。

学术兼职

• 全国研究生教育评估监测专家库专家

• 计算机CCF会员

联系方式

Email: ch_xiaozhou@163.com